机构主要职责:
1、负责推动科技研发和高端制造业、中医药等澳门品牌工业、文旅会展商贸等产业在合作区的发展；
2、负责推动建立科技创新机制，管理和优化科技资源配置，组织实施重大科技研究计划，推动科技研发成果产业化；
3、负责制定和执行合作区投资促进政策，组织实施投资促进计划，牵头开展三大产业的招商引资和统筹对外合作事务；
4、负责依法监督、管理和服务对外投资，负责外商投资信息报告等工作，建立健全合作区投资活动的监管体系；
5、负责统筹、强化合作区的全流程企业服务工作；推动相关产业项目落地及平台建设，促进高端产业要素和资源在合作区集聚；
6、负责统筹横琴国际休闲旅游岛等工作；
7、负责落实合作区分线管理政策，统筹口岸建设管理、制度创新、通关便利化等工作，建立健全口岸通关合作协调机制；
8、负责合作区科技、工信、商务、旅游管理领域的行业监管、公共服务和行政执法工作，行使前述领域的行政处罚权、行政强制权；
9、负责完成执委会交办的其他工作。